iPhoneで、ブラウザー［Safari］を使ってWebページ上のPDFファイルを閲覧していると、［GoodReader（もしくはPDFアプリ名）で開く］、または［次の方法で開く］と書かれたアイコンが画面上部に表示されます。このアイコンをタップすることにより、閲覧中のPDFファイルを、選択したPDFアプリに転送して、閲覧を続けることができます。［次の方法で開く］をタップした場合は、複数のPDFアプリの選択画面が表示されます。このときのアイコンの表示のされ方は、インストールされているPDFアプリの状況により異なります。GoodReader以外にもiBooksなどのPDFアプリでも同様に利用可能です。この操作でGoodReaderで表示されたPDFファイルは、GoodReaderの管理するファイルフォルダに保管されるので、次に閲覧するときはGoodReaderですぐにページが表示され便利です。